由于琵琶湖的水位比输水道水路的水位要高,所以大津闸门在琵琶湖与输水道之间来往时,通过开闭水门来调整琵琶湖和输水道水路的水位差来让船只通过。
除了闸室等重要部分采用石材外,其他都是用砖块砌筑,使用的砖块约达60万块。在明治时期现存的砖造近代闸门中,石井闸门(宫城县重要文化财产)作为最古老的闸门而为人所知,大津闸门作为仅次于石井闸门的近代闸门也备受瞩目。现在,每年“琵琶湖输水船”的运航季节开始和结束时,为了让船只通过,都会开闭闸门。从输水道沿岸可以眺望到此场景,琵琶湖水通过闸门流入输水道的样子,也是一个鲜为人知的看点。